《哥斯拉2：怪兽之王》结尾有彩蛋，彩蛋内容通常是对故事背景的补充，或是为接下来的剧情埋下伏笔。
在影片结尾处的彩蛋中，出现了被哥斯拉咬下的基多拉头颅，一位神秘大佬说道：“我们要了。”网友猜测有两种可能，一种是反派利用基多拉的头研究出新的怪兽，哥斯拉和金刚一起打它；另一种就是反派抓住了金刚，然后用基多拉的基因改造了金刚去打哥斯拉。
此外，彩蛋里还出现了一个神秘蛋，有可能是摩斯拉，它会因为这个神秘蛋而复活，在哥斯拉打败基多拉的过程中起到了很重要的作用。同时，所有的巨兽都前往骷髅岛，这可能是为下一部影片《金刚大战哥斯拉》做准备。
