无公害农产品、绿色食品、有机食品区别为：性质不同、质量标准不同、生产不同。无公害农产品、绿色食品、有机食品都是健康安全的食品。
一、性质不同
1、无公害农产品：无公害农产品是指产地环境、生产过程、产品质量符合国家有关标准和规范的要求，经认证合格获得认证证书并允许使用无公害农产品标志的未经加工或初加工的食用农产品。
2、绿色食品：绿色食品是指遵循可持续发展原则，按照特定生产方式生产，经专门机构认定，许可使用绿色食品标志商标的无污染的安全、优质、营养类食品。
3、有机食品：有机食品是指来自有机农业生产体系，根据有机农业生产要求和相应标准生产加工，并且通过合法的、独立的有机食品认证机构认证的农副产品及其加工品。
二、质量标准不同
1、无公害农产品：无公害农产品质量标准参照国内普通食品卫生标准。
2、绿色食品：绿色食品质量标准参照联合国粮农组织和世界卫生组织标准。
3、有机食品：有机食品质量标准参照欧盟和国际有机运动联盟(1POAM)的有机农业和产品加工基本标准。
三、生产不同
1、无公害农产品：无公害农产品生产必须在良好的生态环境下，遵守无公害农产品技术规程，可以科学、合理地使用化学合成物。
2、绿色食品：绿色食品生产是将传统农业技术与现代常规农业技术相结合。
3、有机食品：有机食品生产必须采用有机生产方式，绝对禁止使用农药，化学色素和防腐剂等化学物质，不使用基因工程技术。